Et si nous remontions 10 000 ans en arrière, lorsque la cité d'Atantis était encore habitée par les Anciens, alors que la terre n'était encore qu'à l'âge de pierre. Revivez la grande guerre opposant les Wraiths et les Anciens dans la galaxie de Pégase. Seriez-vous capable de vous fondre dans un nouvel univers ? Celui que les nouveaux Atlantes ont toujours rêvé de cotoyer... Incarnez un membre du haut conseil Atlante ou un commandant de vaisseau Ancien et tentez de changer la fin de la guerre. Mais les Anciens et les Wraiths ne sont pas les seuls, outre les habitants des différents mondes humains peuplés par les constructeurs de la cité d'Atlantis, les Réplicateurs font eux aussi leur apparition, certes moins puissants que 10000 ans plus tard mais toujours menaçants..